網站欄目的實質是一個網站內容的大綱索引，它集中了各個網頁的名目的索引，引導瀏覽者尋找網站里最需要的內容。
為了使網站的內容安排的有條理，結構關系清楚，網站的欄目需要分層設置，網頁的閱讀方式一般分為幾個層次，上下呈線性分布結構。為了方便，一條線型末端與層次之間要有鏈接設置，如果沒有，瀏覽者只有沿原路返回才能瀏覽。網站的主要信息一定要放在首頁或一二級欄目中。如果有些重要的信息因結構問題不得不放在較深的位置上，一定設法將它放在首頁安排超級鏈接，同時在其他網頁放置多個超級鏈接以便使瀏覽者很容易的找到它。
網站目錄的機構是一個很容易忽略的問題，有些網站設計者為了方便講所有文件都放在跟目錄下，哪些是需要編輯和更新文件、哪些是可刪除文件都混雜在一起，這樣做很容易造成文件管理的混亂，十分影響工作效率。
另外所有文件都在同一個根目錄下，在提交時會造成上傳速度慢，服務器一般都會為根目錄建議一個文件索引，如果你將所有文件都放在根目錄下，即使你僅僅上傳一個更新文件服務器也需要將所有文件檢索一遍，建立新的索引文件，很明顯文件量越大等待的時間也將越長，所以應盡可能減少根目錄下的文件存放數。
目錄結構的好壞對瀏覽者來說并沒有什么太大的感覺，但是對于網站本身的上傳維護內容信息和未來的擴充和移植有著重要的影響，在建立目錄結構的過程中應注意不要講所有文件都存放在根目錄下。